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刘颖,王双耀,高乔,安立会,张鹏,孙静娴,姜志强,郑丙辉,等. 栉孔扇贝内参基因稳定性研究[J]. 生态毒理学报, 2013, 8(4): 616-622
栉孔扇贝内参基因稳定性研究
Study on the Expression Stability of Reference Genes in Chlamys Farreri
投稿时间:2013-03-04  修订日期:2013-06-03
DOI:10.7524/AJE.1673-5897.20130304001
中文关键词:  内参基因  栉孔扇贝  实时定量PCR(RT-qPCR)  RefFinder  EF-l α
英文关键词:reference genes  Chlamys Farreri  real-time quantitative polymerase chain reaction (RT-qPCR)  RefFinder  EF-l α
基金项目:国家自然科学基金(21177117);国家科技支撑计划(2010BAC69B02)
作者单位
刘颖 1. 大连海洋大学水产与生命学院大连 116023
2. 中国环境科学研究院国家环境保护河口与海岸带重点实验室
北京 100012 
王双耀 大连海洋大学水产与生命学院大连 116023 
高乔 大连海洋大学水产与生命学院大连 116023 
安立会 中国环境科学研究院国家环境保护河口与海岸带重点实验室北京 100012 
张鹏 大连海洋大学水产与生命学院大连 116023 
孙静娴 大连海洋大学水产与生命学院大连 116023 
姜志强 大连海洋大学水产与生命学院大连 116023 
郑丙辉 中国环境科学研究院国家环境保护河口与海岸带重点实验室北京 100012 
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中文摘要:
      合适的内参基因对准确定量目标基因表达水平非常重要。利用实时定量聚合酶链式反应(RT-qPCR)分析了不同发育阶段和雌激素暴露条件下栉孔扇贝性腺组织中β-actin、β-TUB、EF-l α、18S rRNA和GAPDH 5个内参基因的表达水平,并利用RefFinder软件对其表达稳定性进行了分析。结果表明:在所考察的内参基因中,EF-l α在栉孔扇贝不同发育阶段和雌激素暴露下的表达均最为稳定,可作为定量目标基因表达水平的内参基因之一。
                       
AuthorAffiliation
Liu Ying1. College of Aquaculture and Life Science, Dalian Ocean University, Dalian 116023, China
2. State Environmental Protection Key Laboratory of Estuarine and Coastal Research, Chinese Research Academy for Environment Sciences, Beijing 100012, China
Wang ShuangyaoCollege of Aquaculture and Life Science, Dalian Ocean University, Dalian 116023, China
Gao QiaoCollege of Aquaculture and Life Science, Dalian Ocean University, Dalian 116023, China
An LihuiState Environmental Protection Key Laboratory of Estuarine and Coastal Research, Chinese Research Academy for Environment Sciences, Beijing 100012, China
Zhang PengCollege of Aquaculture and Life Science, Dalian Ocean University, Dalian 116023, China
Sun JingxianCollege of Aquaculture and Life Science, Dalian Ocean University, Dalian 116023, China
Jiang ZhiqiangCollege of Aquaculture and Life Science, Dalian Ocean University, Dalian 116023, China
Zheng BinghuiState Environmental Protection Key Laboratory of Estuarine and Coastal Research, Chinese Research Academy for Environment Sciences, Beijing 100012, China
英文摘要:
      Appropriate reference gene is very important to precisely quantify the target gene expression. In this present study, five reference genes mRNA expressions, including β-actin, β-TUB, EF-l α, 18S rRNA and GAPDH in Chlamys Farreri gonad , were quantified using real-time quantitative polymerase chain reaction (RT-qPCR). Their expression stability was analyzed online using RefFinder software. The results showed that EF-l α expression was the most stable among these five reference genes in gonad of different development stages and estrogen exposure, suggesting that EF-lα is one of suitable reference gene for quantifying genes expressions in Chlamys Farreri gonad.
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